バイオインフォマティクス（生命情報科学）とは

バイオインフォマティクスで扱う主なデータ

バイオインフォマティクスでは、さまざまな種類の生命データを対象とします。
ゲノムデータでは、DNA配列／遺伝子変異／一塩基多型／構造変異などを解析します。疾患関連遺伝子の探索や個人差の理解を目的としています。
トランスクリプトームデータでは、どの遺伝子がどの程度発現しているかを調べます。細胞の状態や疾患の進行、薬剤応答などの理解に使われます。
プロテオームデータでは、タンパク質の量、構造、相互作用、翻訳後修飾などを解析します。タンパク質は細胞機能を直接担うため、生命現象の理解に適しています。
他にもメタボロームデータやメタゲノムデータなど様々なものがあります。

バイオインフォマティクスに必要なスキル

バイオインフォマティクスには、生命科学と情報科学の両方の知識が求められます。
具体的には、分子生物学／遺伝学／統計学／プログラミング／データベース／機械学習／Linux環境での解析などです。

当研究室におけるバイオインフォマティクス

現在、各記事準備中

• オミクス解析
  • ゲノム解析
    • Whole Exome Sequencing
    • Target-seq
    • Cas9 screening
    • LinkPrep
  • エピゲノム解析
    • ATAC-seq
    • CUT&Tag
  • トランスクリプトーム解析
    • bulkRNA-seq
    • scRNA-seq
    • Visium
    • smRNA-seq
• 構造生命情報学
  • 分子動力学シミュレーション
• 下流解析
  • ネットワーク解析
  • パスウェイ解析
  • 統合解析