学部3年生が３ヶ月間の基礎研究体験を修了しました。
岡山大学医学部では3年次の10月から12月の３ヶ月間、希望した研究室に配属されて基礎研究を体験する講義、医学研究インターンシップ（略称 MRI）があります。
当研究室では3人まで受け入れており、今年配属された学生は2人がwet研究、1人がdry研究をすることになりました。
今年の基礎研究は2021年に発表されて話題になった「AlphaFold2を使ってみる」ことに挑戦しました。
これまでプログラミングに一切触れたことのない学生が、HPCにアカウント登録することから始まり、Linuxコマンドの使用などを経てAlphaFold2を実行するジョブを実行するところまで辿り着きました。
AlphaFold2で予測された構造をPyMOLで描画し、回転するGIF画像の作成もできました。
分子動力学シミュレーションの本シミュレーションまでは辿り着けませんでしたが、平衡化などの体験をしました。
３ヶ月という短い時間でしたが、コンピュータだけで研究するというこれまで触れたことのない実験は大変だったと思います。
お疲れ様でした。